우간다는 월드미션 프론티어의 아프리카 선교전략상 중요한 위치로서 수도 캄팔라 근교에 20 에이커의 대학 부지를 마련하고 현재 성전 1동, 교실 8동 및 부대시설을 건축하고 유치원과 초등학교가 운영되고 있으며, 기술대학과 신학대학 및 의과대학의 설립을 목표로 건축이 계속되고 있다. 우간다 선교부는 미래적으로 수단 및 북아프리카 선교의 교두보가 될 것으로 예상되어 많은 투자가 요청된다.
현재는 이미경선교사가 파송되어 사역하고 있다.
월드미션 프론티어의 탄자니아 선교는 1994년 르완다 난민선교로 시작되었다. 10만명의 르완다 난민들이 거주하던 카라괴 난민촌에 설립된 난민촌 신학교에서는 150명의 르완다 난민을 전도자로 양성하였으며, 난민 유치원이 운영되었다. 1997년 1월 르완다 난민들이 강제로 귀환되었지만 지금은 수십만의 부룬디 난민과 콩고 난민들이 탄자니아에 거주하고 있어, 월드미션 프론티어의 난민사역은 계속되고 있다.
월드미션 프론티어는 특히 탄자니아의 빅토리아 호수의 항구도시인 Mwanza와 Bukoba를 중심으로 빅토리아 호수의 섬 사람들을 위한 의료선 선교가 준비되고 있는데 2006년 선박의 건조를 목표로 하고 있다. 또한 Arusha를 중심으로 킬리만자로 산 주변에서 문명을 거부하고 살아가는 마사이 선교가 시작될 예정이다.